1、微生物在自然界物質迴圈中起巨大作用,微生物可分解有機物。
2、在農業生產中,微生物是土壤肥力的重要因素,可分解有機殘體,促進難溶性礦物轉化,固定空氣中氮素,增加土壤有效養分,促進土壤團粒結構的形成。 還可利用其進行沼氣發酵。產生多種抗生素,能防治作物病害和雜草。
3、工業生產中有的是直接利用其菌體,有的是利用其代謝產物或代謝活動。
4、環境保護方面,利用其處理汙水,汙物,毒物,消除汙染,保護環境。
5、微生物與人類及畜禽的健康關係密切,如有些生活在動物腸道內,可合成維生素,氨基酸等,為宿主提供營養。其產生的抗生素可治療人類及畜禽的傳染性病害。